操作R语言举办方差阐明
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2019-06-14

操作R语言举办方差阐明

操作R语言举办方差阐明

一、单因子方差分析(one-way ANOVA)

1)建模:

我们采用multcomp包中的cholesterol数据集作为例子,其中response为响应变量,trt为预测变量,这个处理中有五种水平。从下面的箱形图中可观察到处理的不同水平对于响应变量的影响。再用aov函数建立单因子方差模型,从结果的P值可看到各组均值有显著不同。

1 aggregate(response, by=list(trt), FUN=mean)
2 bwplot(response~trt)
3 model=aov(response~trt)
4 summary(model)

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2)多重比较:

方差分析只告诉我们这五组之间是不同的,但没有告诉我们哪两组之间有明显差别,此时需要使用TukeyHSD函数进行均值的多重比较分析,从结果中观察到有三个两两比较是不显著的。

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